Научно-организационный отдел координирует вопросы:

• организационного обеспечения программно-целевого планирования основных направлений научно-исследовательской и научно-практической деятельности Центра.

Научно-организационный отдел осуществляет:

• работу в библиографической базе РИНЦ и других информационно-аналитических базах; актуализация профиля учреждения; анализ публикационной активности сотрудников. Оказывает научно-методическую, консультативную помощь сотрудникам по работе в библиографических базах;
• формирование отчетных материалов: составляет и представляет в установленном порядке отчетность по текущим НИР по вопросам, относящимся к компетенции отдела;
• методическую помощь в проведении коллективных мероприятий научно-практического характера — конференций, семинаров, круглых столов;
• организацию и проведение Клинических конференций, проводимых в рамках системы Непрерывного медицинского образования (НМО) Министерства здравоохранения РФ, подготовку отчётности;
• контроль результатов научной деятельности подразделений Центра; отчетность об участии научных сотрудников Центра в конференциях, съездах, симпозиумах, комплектование картотеки публикаций;
• развитие научно-информационной деятельности путём внедрения новых информационных технологий;
• организацию (методическое и документальное сопровождение) клинических исследований лекарственных препаратов для медицинского применения в соответствии с полученной аккредитацией;
• организационное, методическое сопровождение конкурса на замещение вакантных должностей научных сотрудников;
• организационное, методическое и информационное сопровождение эффективного контракта.